Diplômé de l’École nationale de théâtre en 1990, Fabien Dupuis se taille rapidement une place dans le milieu artistique.
À la télévision, il a fait ses débuts dans Scoop, Les héritiers Duval puis Soif de vivre puis, Sauve qui peut, Une voix en or, Watatatow, Le monde de Charlotte, Une grenade avec ça, KM/H, Rumeur, Tout sur moi et Virginie. Plus récemment, nous avons pu le voir dans Les pêcheurs réalisés par Jean-François Asselin. En 2017, il est de la distribution de la télésérie L'heure bleue, réalisée par Stéphan Beaudoin.